Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
B020011L13RikA0A087WQI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
B020011L13RikA0A087WQI7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B020011L13RikA0A087WQI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B020011L13RikA0A087WQI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020011L13RikA0A087WQI7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms