Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
1700019A02RikA0A087WPV9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
1700019A02RikA0A087WPV9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
1700019A02RikA0A087WPV9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
1700019A02RikA0A087WPV9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
1700019A02RikA0A087WPV9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms