Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNP1

Gm28168, Predicted gene 28168, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28168A0A087WNP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm28168A0A087WNP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm28168A0A087WNP1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm28168A0A087WNP1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm28168A0A087WNP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm28168A0A087WNP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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