Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
GTF3C6Q969F1 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms