Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COL24A1Q17RW2 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms