Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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CCDC142Q17RM4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC142Q17RM4 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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