Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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