Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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SIX1Q15475 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SIX1Q15475 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SIX1Q15475 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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