Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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BRD3Q15059 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BRD3Q15059 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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