Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SGCGQ13326 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SGCGQ13326 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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