Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CHAF1BQ13112 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CHAF1BQ13112 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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