Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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