Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COPS7AQ9UBW8 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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