Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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