Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ZFP57-201ENST00000376881 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P6-201ENST00000434005 1384 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PKD2L2-201ENST00000290431 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SNORA57.2-201ENST00000391265 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MAP3K7CL-205ENST00000399926 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TRIB2-203ENST00000405331 830 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ING4-203ENST00000412586 741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090617.1-201ENST00000413674 323 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR10U1P-201ENST00000414690 905 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ATP5G1P8-201ENST00000416294 294 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ING4-204ENST00000423703 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 VOPP1-205ENST00000427700 632 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ING4-206ENST00000444704 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 TMBIM1-215ENST00000445635 1251 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP000266.1-201ENST00000450936 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL390026.1-201ENST00000456647 457 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 CENPS-202ENST00000462462 584 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL40P-201ENST00000474689 342 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL672142.1-201ENST00000482796 378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL384P-201ENST00000490382 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 OR4D7P-201ENST00000534196 942 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RN7SL577P-201ENST00000584532 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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