Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms