Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CUL1Q13616 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms