Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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