Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ZBED1O96006 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms