Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
EHD3Q9NZN3 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
EHD3Q9NZN3 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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