Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ATG16L1Q676U5 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms