Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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CCDC93Q567U6 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC93Q567U6 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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