Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.7 ms