Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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VPS72Q15906 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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