Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms