Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SYCP1Q15431 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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