Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms