Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CUL4AQ13619 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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