Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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ITGB3BPQ13352 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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ITGB3BPQ13352 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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ITGB3BPQ13352 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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