Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF4Q08170 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms