Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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