Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NREPQ16612 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NREPQ16612 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms