Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC093844.1-201ENST00000514910 1361 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms