Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms