Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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