Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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