Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NME3Q13232 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NME3Q13232 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms