Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms