Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SGTAO43765 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SGTAO43765 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms