Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CTXN3Q4LDR2 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CTXN3Q4LDR2 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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