Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.2 ms