Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FOXF2Q12947 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms