Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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PTPRAP18433 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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