Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
LINC00587B1AMM8 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC100832.2-201ENST00000582080 776 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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LINC00587B1AMM8 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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