Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RNF17Q9BXT8 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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