Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms