Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
RUNX3Q13761 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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