Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 U3.14-201ENST00000365363 227 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL139327.1-201ENST00000382988 348 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RN7SKP127-201ENST00000410443 354 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SLC16A4-206ENST00000472422 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 GC-208ENST00000513476 1567 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 EPHB2-201ENST00000374627 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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MKRN3Q13064 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
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