Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CENPFP49454 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
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CENPFP49454 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CENPFP49454 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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