Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LMNB1P20700 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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